https://bioinformaticsonline.com/snippets/view/43098/install-kat-using-conda? https://bioinformaticsonline.com/snippets/view/43098/install-kat-using-conda Thu, 24 Jun 2021 04:31:31 -0500 https://bioinformaticsonline.com/snippets/view/43098/install-kat-using-conda conda install -c bioconda kat Collecting package metadata (current_repodata.json): done Solving environment: failed with initial frozen solve. Retrying with flexible solve. Solving environment: failed with repodata from current_repodata.json, will retry with next repodata source. Collecting package metadata (repodata.json): done Solving environment: done ## Package Plan ## environment location: /home/anaconda3/envs/ added / updated specs: - kat The following packages will be downloaded: package | build ---------------------------|----------------- boost-1.73.0 | py37h06a4308_11 25 KB jellyfish-2.2.10 | h6bb024c_1 393 KB bioconda jemalloc-4.5.0 | 0 6.2 MB bioconda kat-2.0.8 | 0 7.5 MB bioconda libboost-1.73.0 | h3ff78a5_11 13.9 MB lz4-c-1.9.3 | h2531618_0 186 KB py-boost-1.73.0 | py37ha9443f7_11 204 KB zstd-1.4.9 | haebb681_0 480 KB ------------------------------------------------------------ Total: 28.8 MB The following NEW packages will be INSTALLED: boost pkgs/main/linux-64::boost-1.73.0-py37h06a4308_11 jellyfish bioconda/linux-64::jellyfish-2.2.10-h6bb024c_1 jemalloc bioconda/linux-64::jemalloc-4.5.0-0 kat bioconda/linux-64::kat-2.0.8-0 libboost pkgs/main/linux-64::libboost-1.73.0-h3ff78a5_11 lz4-c pkgs/main/linux-64::lz4-c-1.9.3-h2531618_0 py-boost pkgs/main/linux-64::py-boost-1.73.0-py37ha9443f7_11 zstd pkgs/main/linux-64::zstd-1.4.9-haebb681_0 The following packages will be UPDATED: libxslt conda-forge::libxslt-1.1.33-h15afd5d_2 --> pkgs/main::libxslt-1.1.34-hc22bd24_0 The following packages will be SUPERSEDED by a higher-priority channel: icu conda-forge::icu-68.1-h58526e2_0 --> pkgs/main::icu-58.2-he6710b0_3 libxml2 conda-forge::libxml2-2.9.12-h72842e0_0 --> pkgs/main::libxml2-2.9.10-hb55368b_3 Proceed ([y]/n)? y Downloading and Extracting Packages libboost-1.73.0 | 13.9 MB | ################################################################################################################################################################################### | 100% zstd-1.4.9 | 480 KB | ################################################################################################################################################################################### | 100% lz4-c-1.9.3 | 186 KB | ################################################################################################################################################################################### | 100% py-boost-1.73.0 | 204 KB | ################################################################################################################################################################################### | 100% kat-2.0.8 | 7.5 MB | ################################################################################################################################################################################### | 100% jellyfish-2.2.10 | 393 KB | ################################################################################################################################################################################### | 100% jemalloc-4.5.0 | 6.2 MB | ################################################################################################################################################################################### | 100% boost-1.73.0 | 25 KB | ################################################################################################################################################################################### | 100% Preparing transaction: done Verifying transaction: done Executing transaction: done]]> Neel