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Install grabseqs using conda !
By LEGE 1046 days ago
vik@vik-Lenovo-ideapad-320-15ISK:~/Downloads/setu/setu$ conda install grabseqs -c louiejtaylor -c bioconda -c conda-forge
Collecting package metadata (current_repodata.json): done
Solving environment: done
==> WARNING: A newer version of conda exists. <==
current version: 4.9.2
latest version: 4.10.1
Please update conda by running
$ conda update -n base -c defaults conda
## Package Plan ##
environment location: /home/vik/anaconda3/envs/vikENV
added / updated specs:
- grabseqs
The following packages will be downloaded:
package | build
---------------------------|-----------------
_openmp_mutex-4.5 | 1_gnu 22 KB conda-forge
beautifulsoup4-4.9.3 | pyhb0f4dca_0 86 KB conda-forge
c-ares-1.17.1 | h7f98852_1 109 KB conda-forge
ca-certificates-2021.5.30 | ha878542_0 136 KB conda-forge
certifi-2021.5.30 | py37h89c1867_0 141 KB conda-forge
cffi-1.14.5 | py37hc58025e_0 225 KB conda-forge
cryptography-3.4.7 | py37h5d9358c_0 1.1 MB conda-forge
cssselect-1.1.0 | py_0 18 KB conda-forge
curl-7.77.0 | hea6ffbf_0 149 KB conda-forge
fake-useragent-0.1.11 | py37_0 19 KB louiejtaylor
grabseqs-0.7.0 | py37_0 22 KB louiejtaylor
hdf5-1.10.6 |nompi_h6a2412b_1114 3.1 MB conda-forge
icu-68.1 | h58526e2_0 13.0 MB conda-forge
krb5-1.19.1 | hcc1bbae_0 1.4 MB conda-forge
libblas-3.9.0 | 9_openblas 11 KB conda-forge
libcblas-3.9.0 | 9_openblas 11 KB conda-forge
libcurl-7.77.0 | h2574ce0_0 334 KB conda-forge
libgcc-ng-9.3.0 | h2828fa1_19 7.8 MB conda-forge
libgfortran-ng-9.3.0 | hff62375_19 22 KB conda-forge
libgfortran5-9.3.0 | hff62375_19 2.0 MB conda-forge
libgomp-9.3.0 | h2828fa1_19 376 KB conda-forge
libidn2-2.3.1 | h7f98852_0 97 KB conda-forge
liblapack-3.9.0 | 9_openblas 11 KB conda-forge
libopenblas-0.3.15 |pthreads_h8fe5266_1 9.2 MB conda-forge
libssh2-1.9.0 | ha56f1ee_6 226 KB conda-forge
libstdcxx-ng-9.3.0 | h6de172a_19 4.0 MB conda-forge
libxml2-2.9.12 | h72842e0_0 772 KB conda-forge
libxslt-1.1.33 | h15afd5d_2 522 KB conda-forge
lxml-4.6.3 | py37h77fd288_0 1.5 MB conda-forge
ncbi-ngs-sdk-2.11.0 | hff44eed_0 167 KB bioconda
numpy-1.20.3 | py37h038b26d_1 5.7 MB conda-forge
openssl-1.1.1k | h7f98852_0 2.1 MB conda-forge
ossuuid-1.6.2 | hf484d3e_1000 56 KB conda-forge
pandas-1.2.4 | py37h219a48f_0 11.8 MB conda-forge
parse-1.19.0 | pyh44b312d_0 22 KB conda-forge
perl-xml-libxml-2.0132 | pl526h7ec2d77_1 260 KB bioconda
pigz-2.6 | h27826a3_0 87 KB conda-forge
pip-21.1.2 | pyhd8ed1ab_0 1.1 MB conda-forge
pyee-7.0.4 | pyh9f0ad1d_0 14 KB conda-forge
pyppeteer-0.2.2 | py_1 104 KB conda-forge
pyquery-1.4.3 | pyhd8ed1ab_0 23 KB conda-forge
python-3.7.10 |hffdb5ce_100_cpython 57.3 MB conda-forge
pytz-2021.1 | pyhd8ed1ab_0 239 KB conda-forge
readline-8.1 | h46c0cb4_0 295 KB conda-forge
requests_html-0.10.0 | py37_1 23 KB louiejtaylor
six-1.16.0 | pyh6c4a22f_0 14 KB conda-forge
soupsieve-2.0.1 | py_1 30 KB conda-forge
sqlite-3.35.5 | h74cdb3f_0 1.4 MB conda-forge
sra-tools-2.11.0 | pl5262h314213e_0 64.5 MB bioconda
tqdm-4.61.1 | pyhd8ed1ab_0 79 KB conda-forge
urllib3-1.26.5 | pyhd8ed1ab_0 99 KB conda-forge
w3lib-1.22.0 | pyh9f0ad1d_0 21 KB conda-forge
websockets-8.1 | py37h5e8e339_3 90 KB conda-forge
------------------------------------------------------------
Total: 191.9 MB
The following NEW packages will be INSTALLED:
_libgcc_mutex conda-forge/linux-64::_libgcc_mutex-0.1-conda_forge
_openmp_mutex conda-forge/linux-64::_openmp_mutex-4.5-1_gnu
appdirs conda-forge/noarch::appdirs-1.4.4-pyh9f0ad1d_0
beautifulsoup4 conda-forge/noarch::beautifulsoup4-4.9.3-pyhb0f4dca_0
brotlipy conda-forge/linux-64::brotlipy-0.7.0-py37h5e8e339_1001
c-ares conda-forge/linux-64::c-ares-1.17.1-h7f98852_1
ca-certificates conda-forge/linux-64::ca-certificates-2021.5.30-ha878542_0
certifi conda-forge/linux-64::certifi-2021.5.30-py37h89c1867_0
cffi conda-forge/linux-64::cffi-1.14.5-py37hc58025e_0
chardet conda-forge/linux-64::chardet-4.0.0-py37h89c1867_1
cryptography conda-forge/linux-64::cryptography-3.4.7-py37h5d9358c_0
cssselect conda-forge/noarch::cssselect-1.1.0-py_0
curl conda-forge/linux-64::curl-7.77.0-hea6ffbf_0
fake-useragent louiejtaylor/linux-64::fake-useragent-0.1.11-py37_0
gettext conda-forge/linux-64::gettext-0.19.8.1-h0b5b191_1005
grabseqs louiejtaylor/linux-64::grabseqs-0.7.0-py37_0
hdf5 conda-forge/linux-64::hdf5-1.10.6-nompi_h6a2412b_1114
icu conda-forge/linux-64::icu-68.1-h58526e2_0
idna conda-forge/noarch::idna-2.10-pyh9f0ad1d_0
krb5 conda-forge/linux-64::krb5-1.19.1-hcc1bbae_0
ld_impl_linux-64 conda-forge/linux-64::ld_impl_linux-64-2.35.1-hea4e1c9_2
libblas conda-forge/linux-64::libblas-3.9.0-9_openblas
libcblas conda-forge/linux-64::libcblas-3.9.0-9_openblas
libcurl conda-forge/linux-64::libcurl-7.77.0-h2574ce0_0
libedit conda-forge/linux-64::libedit-3.1.20191231-he28a2e2_2
libev conda-forge/linux-64::libev-4.33-h516909a_1
libffi conda-forge/linux-64::libffi-3.3-h58526e2_2
libgcc-ng conda-forge/linux-64::libgcc-ng-9.3.0-h2828fa1_19
libgfortran-ng conda-forge/linux-64::libgfortran-ng-9.3.0-hff62375_19
libgfortran5 conda-forge/linux-64::libgfortran5-9.3.0-hff62375_19
libgomp conda-forge/linux-64::libgomp-9.3.0-h2828fa1_19
libiconv conda-forge/linux-64::libiconv-1.16-h516909a_0
libidn2 conda-forge/linux-64::libidn2-2.3.1-h7f98852_0
liblapack conda-forge/linux-64::liblapack-3.9.0-9_openblas
libnghttp2 conda-forge/linux-64::libnghttp2-1.43.0-h812cca2_0
libopenblas conda-forge/linux-64::libopenblas-0.3.15-pthreads_h8fe5266_1
libssh2 conda-forge/linux-64::libssh2-1.9.0-ha56f1ee_6
libstdcxx-ng conda-forge/linux-64::libstdcxx-ng-9.3.0-h6de172a_19
libunistring conda-forge/linux-64::libunistring-0.9.10-h14c3975_0
libxml2 conda-forge/linux-64::libxml2-2.9.12-h72842e0_0
libxslt conda-forge/linux-64::libxslt-1.1.33-h15afd5d_2
lxml conda-forge/linux-64::lxml-4.6.3-py37h77fd288_0
ncbi-ngs-sdk bioconda/linux-64::ncbi-ngs-sdk-2.11.0-hff44eed_0
ncurses conda-forge/linux-64::ncurses-6.2-h58526e2_4
numpy conda-forge/linux-64::numpy-1.20.3-py37h038b26d_1
openssl conda-forge/linux-64::openssl-1.1.1k-h7f98852_0
ossuuid conda-forge/linux-64::ossuuid-1.6.2-hf484d3e_1000
pandas conda-forge/linux-64::pandas-1.2.4-py37h219a48f_0
parse conda-forge/noarch::parse-1.19.0-pyh44b312d_0
perl conda-forge/linux-64::perl-5.26.2-h36c2ea0_1008
perl-app-cpanminus bioconda/linux-64::perl-app-cpanminus-1.7044-pl526_1
perl-business-isbn bioconda/linux-64::perl-business-isbn-3.004-pl526_0
perl-business-isb~ bioconda/linux-64::perl-business-isbn-data-20140910.003-pl526_0
perl-carp bioconda/linux-64::perl-carp-1.38-pl526_3
perl-constant bioconda/linux-64::perl-constant-1.33-pl526_1
perl-data-dumper bioconda/linux-64::perl-data-dumper-2.173-pl526_0
perl-encode bioconda/linux-64::perl-encode-2.88-pl526_1
perl-exporter bioconda/linux-64::perl-exporter-5.72-pl526_1
perl-extutils-mak~ bioconda/linux-64::perl-extutils-makemaker-7.36-pl526_1
perl-file-path bioconda/linux-64::perl-file-path-2.16-pl526_0
perl-file-temp bioconda/linux-64::perl-file-temp-0.2304-pl526_2
perl-mime-base64 bioconda/linux-64::perl-mime-base64-3.15-pl526_1
perl-parent bioconda/linux-64::perl-parent-0.236-pl526_1
perl-uri bioconda/linux-64::perl-uri-1.76-pl526_0
perl-xml-libxml bioconda/linux-64::perl-xml-libxml-2.0132-pl526h7ec2d77_1
perl-xml-namespac~ bioconda/linux-64::perl-xml-namespacesupport-1.12-pl526_0
perl-xml-sax bioconda/noarch::perl-xml-sax-1.02-pl526_0
perl-xml-sax-base bioconda/linux-64::perl-xml-sax-base-1.09-pl526_0
perl-xsloader bioconda/linux-64::perl-xsloader-0.24-pl526_0
pigz conda-forge/linux-64::pigz-2.6-h27826a3_0
pip conda-forge/noarch::pip-21.1.2-pyhd8ed1ab_0
pycparser conda-forge/noarch::pycparser-2.20-pyh9f0ad1d_2
pyee conda-forge/noarch::pyee-7.0.4-pyh9f0ad1d_0
pyopenssl conda-forge/noarch::pyopenssl-20.0.1-pyhd8ed1ab_0
pyppeteer conda-forge/noarch::pyppeteer-0.2.2-py_1
pyquery conda-forge/noarch::pyquery-1.4.3-pyhd8ed1ab_0
pysocks conda-forge/linux-64::pysocks-1.7.1-py37h89c1867_3
python conda-forge/linux-64::python-3.7.10-hffdb5ce_100_cpython
python-dateutil conda-forge/noarch::python-dateutil-2.8.1-py_0
python_abi conda-forge/linux-64::python_abi-3.7-1_cp37m
pytz conda-forge/noarch::pytz-2021.1-pyhd8ed1ab_0
readline conda-forge/linux-64::readline-8.1-h46c0cb4_0
requests conda-forge/noarch::requests-2.25.1-pyhd3deb0d_0
requests_html louiejtaylor/linux-64::requests_html-0.10.0-py37_1
setuptools conda-forge/linux-64::setuptools-49.6.0-py37h89c1867_3
six conda-forge/noarch::six-1.16.0-pyh6c4a22f_0
soupsieve conda-forge/noarch::soupsieve-2.0.1-py_1
sqlite conda-forge/linux-64::sqlite-3.35.5-h74cdb3f_0
sra-tools bioconda/linux-64::sra-tools-2.11.0-pl5262h314213e_0
tk conda-forge/linux-64::tk-8.6.10-h21135ba_1
tqdm conda-forge/noarch::tqdm-4.61.1-pyhd8ed1ab_0
urllib3 conda-forge/noarch::urllib3-1.26.5-pyhd8ed1ab_0
w3lib conda-forge/noarch::w3lib-1.22.0-pyh9f0ad1d_0
websockets conda-forge/linux-64::websockets-8.1-py37h5e8e339_3
wget conda-forge/linux-64::wget-1.20.1-h22169c7_0
wheel conda-forge/noarch::wheel-0.36.2-pyhd3deb0d_0
xz conda-forge/linux-64::xz-5.2.5-h516909a_1
zlib conda-forge/linux-64::zlib-1.2.11-h516909a_1010
Proceed ([y]/n)? y
Downloading and Extracting Packages
libblas-3.9.0 | 11 KB | ################################################################################################################################################################## | 100%
certifi-2021.5.30 | 141 KB | ################################################################################################################################################################## | 100%
pip-21.1.2 | 1.1 MB | ################################################################################################################################################################## | 100%
pandas-1.2.4 | 11.8 MB | ################################################################################################################################################################## | 100%
requests_html-0.10.0 | 23 KB | ################################################################################################################################################################## | 100%
sra-tools-2.11.0 | 64.5 MB | ################################################################################################################################################################## | 100%
ossuuid-1.6.2 | 56 KB | ################################################################################################################################################################## | 100%
libxml2-2.9.12 | 772 KB | ################################################################################################################################################################## | 100%
websockets-8.1 | 90 KB | ################################################################################################################################################################## | 100%
lxml-4.6.3 | 1.5 MB | ################################################################################################################################################################## | 100%
w3lib-1.22.0 | 21 KB | ################################################################################################################################################################## | 100%
python-3.7.10 | 57.3 MB | ################################################################################################################################################################## | 100%
openssl-1.1.1k | 2.1 MB | ################################################################################################################################################################## | 100%
libcblas-3.9.0 | 11 KB | ################################################################################################################################################################## | 100%
soupsieve-2.0.1 | 30 KB | ################################################################################################################################################################## | 100%
urllib3-1.26.5 | 99 KB | ################################################################################################################################################################## | 100%
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libstdcxx-ng-9.3.0 | 4.0 MB | ################################################################################################################################################################## | 100%
libopenblas-0.3.15 | 9.2 MB | ################################################################################################################################################################## | 100%
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libgcc-ng-9.3.0 | 7.8 MB | ################################################################################################################################################################## | 100%
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libgfortran-ng-9.3.0 | 22 KB | ################################################################################################################################################################## | 100%
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libgfortran5-9.3.0 | 2.0 MB | ################################################################################################################################################################## | 100%
Preparing transaction: done
Verifying transaction: done
Executing transaction: done
